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熒光定量PCR儀校準(zhǔn)方法與結(jié)果情況

更新時間:2022-04-28點擊次數(shù):5910

熒光定量PCR儀校準(zhǔn)方法與結(jié)果情況


實時熒光定量PCR儀特異性更強,自動化程度更高,且有效地解決了PCR污染的問題,應(yīng)用領(lǐng)域及應(yīng)用量都不斷增加。但其設(shè)計更為復(fù)雜,溫度模塊和光學(xué)系統(tǒng)設(shè)計同時影響其性能和實驗準(zhǔn)確性,為定量PCR儀校準(zhǔn)帶來了巨大挑戰(zhàn)。采用生物試劑等方式對定量PCR儀熒光部分校準(zhǔn)缺乏溯源性,無法分析誤差來源,存在較大缺陷。


PCR儀操作簡單、靈敏度高,被廣泛地應(yīng)用于分子生物學(xué)中。但傳統(tǒng)PCR儀不能準(zhǔn)確定量,操作過程中易污染使得假陽性率高等缺陷。熒光定量PCR技術(shù)是在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團,利用熒光信號的積累實時監(jiān)控整個PCR反應(yīng)過程,最后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進(jìn)行定量分析的方法。這一技術(shù)特異性更強,自動化程度更高,且有效地解決了PCR污染。


因此,實時熒光定量PCR儀逐步取代普通PCR儀在臨床檢驗、檢驗檢疫、法醫(yī)鑒定、疾病控制、體外診斷試劑制造和研發(fā)、生物技術(shù)產(chǎn)品研發(fā)等領(lǐng)域得到了更為廣泛的應(yīng)用。熒光定量PCR儀在普通PCR儀的技術(shù)上增加了熒光激發(fā)裝置和檢測系統(tǒng),包含激發(fā)光光源、濾光片、鏡頭和熒光檢測器等。檢測系統(tǒng)有超低溫CCD成像系統(tǒng)和光電倍增管PMT。


熒光定量PCR儀光學(xué)校準(zhǔn)方法與結(jié)果分析的性能起到?jīng)Q定性控制作用,共同決定最終實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。因此,對定量PCR儀的校準(zhǔn)需求也逐步從單純的溫場校準(zhǔn)轉(zhuǎn)向溫度加熒光的復(fù)合參數(shù)校準(zhǔn)。


1,熒光定量PCR儀校準(zhǔn)現(xiàn)狀

相對于傳統(tǒng)PCR儀,熒光定量PCR儀的影響因素更為復(fù)雜,主要因素包含化學(xué)試劑、溫度模塊的溫度因數(shù)、頂蓋溫度因數(shù)、鏡頭、反光鏡和光路通道、熒光接收器的敏感度、機械組成部分、熒光信號處理軟件的閾值設(shè)定,如基線,基線設(shè)定,S/N比例探測等,這就為熒光定量PCR儀的校準(zhǔn)帶來了巨大的挑戰(zhàn)。


國內(nèi)校準(zhǔn)機構(gòu)目前針對熒光定量PCR儀的校準(zhǔn)主要分為兩種情況:

一種是僅對熒光定量PCR儀的溫場部分進(jìn)行校準(zhǔn),這種方法無法對熒光定量PCR儀光學(xué)部分進(jìn)行校準(zhǔn),所獲得的結(jié)果不能對熒光定量PCR儀的性能進(jìn)行全面評估;

另外一種方法是利用化學(xué)試劑對熒光定量PCR儀的進(jìn)行熒光檢測,這種方法同樣存在極大缺陷。首先采用化學(xué)方法對定量PCR儀熒光系統(tǒng)進(jìn)行校準(zhǔn),無法溯源到任何*的標(biāo)準(zhǔn),不具備溯源性。其次,梯度稀釋試劑的過程中由于人為操作會引入一定的誤差,誤差值可能較大,直接影響到最終的檢測結(jié)果。最重要的是,采用這種方法進(jìn)行校準(zhǔn),無法說明熒光定量PCR儀的溫度和熒光對最終定量結(jié)果的影響關(guān)系,誤差多少及誤差來源等。


隨著定量PCR儀的應(yīng)用越來越廣泛,使用者迫切需要對熒光定量PCR儀的性能進(jìn)行評估。在現(xiàn)有檢測手段無法滿足需求的情況下,熒光定量PCR儀使用者普遍采用兩種方式自行對儀器狀態(tài)進(jìn)行判斷,一種是使用生物試劑測試盤這種檢測方法和采用已知濃度的質(zhì)粒DNA標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)對樣本線性誤差進(jìn)行校準(zhǔn)的方法都屬于化學(xué)方法,這種方法僅能夠針對孔與孔間的組合線性進(jìn)行測量,所得結(jié)果僅能代表PCR儀孔與孔間的平均結(jié)果,不能代表單孔的線性,無法真實反映儀器的性能。另一種方法是采用多臺不同廠家或型號定量PCR儀實驗比對的方式來比較不同儀器間的系統(tǒng)誤差,判斷系統(tǒng)誤差是否在臨床接受范圍內(nèi)。這種方法既不具備溯源性,又需要對單個項目進(jìn)行實驗比對,成本較高。


影響定量PCR儀結(jié)果重復(fù)性的2個主要原因是邊緣效應(yīng)和實驗誤差,而邊緣效應(yīng)是由于光路設(shè)計缺陷和控溫模塊缺陷導(dǎo)致的。如果光路設(shè)計存在缺陷,會導(dǎo)致PCR儀樣品槽的邊緣孔和中間孔光程存在差異,不同反映孔間熒光基團獲得的激發(fā)光能量存在差異,最終影響實驗結(jié)果。同時,加熱模塊的空間溫差同樣會導(dǎo)致這種邊緣效應(yīng),研究表明,孔間溫差的微小差別可能在基因擴增的過程中被指數(shù)級放大,最終影響實驗結(jié)果。此外,光路設(shè)計缺陷和孔間溫差的存在還會直接影響到熔解曲線的結(jié)果,使得不同儀器對熔解曲線的分辨率存在明顯差異。在通過熔解曲線檢測突變或進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性分析時,這種影響會導(dǎo)致無法成功區(qū)分突變基因或誤判突變基因。


因此,對定量PCR儀更加全面科學(xué)的校準(zhǔn)方式是采用可溯源物理手段同時對熒光定量PCR儀的溫度部分和光學(xué)部分進(jìn)行校準(zhǔn),并分析二者之間的聯(lián)系,以保障實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性。


2,定量PCR儀光學(xué)校準(zhǔn)系統(tǒng)

基于上述定量PCR儀校準(zhǔn)需求,本文采用Cyclertest3Doptical定量PCR儀光學(xué)校準(zhǔn)系統(tǒng)對定量PCR儀的溫場和熒光系統(tǒng)進(jìn)行全面校準(zhǔn)。系統(tǒng)在原有的PCR儀溫度校準(zhǔn)系統(tǒng)基礎(chǔ)上運用可溯源光譜理論,將溫度和熒光檢測相結(jié)合,模擬定量PCR儀試驗,不僅可以對溫度模塊、上蓋溫度進(jìn)行檢測,還能同時對熒光系統(tǒng)進(jìn)行檢測,并分析而二者的相關(guān)性,更準(zhǔn)確地確定定量PCR儀誤差及誤差來源。


前端傳感器示意圖檢測系統(tǒng)鑲嵌經(jīng)校準(zhǔn)并可用光譜儀溯源的發(fā)光LEG,通過給定電流量的不同會產(chǎn)生不同區(qū)強度的熒光模擬標(biāo)準(zhǔn)熒光激發(fā),并通過對熒光激發(fā)部分的溫度控制。


這種設(shè)計避免了光譜的漂移,保證LEG的激發(fā)光在運行過程中保持絕對的同一水平,這種采用物理手段進(jìn)行檢測,避免了人為操作引入的誤差,更加準(zhǔn)確。這種熒光檢測方法通過了國際認(rèn)證,運用了可溯源光譜理論,可溯源溫度計量來對熒光定量PCR進(jìn)行*的檢測,系統(tǒng)根據(jù)溯源性、可靠性和準(zhǔn)確性。


系統(tǒng)溫度部分可以對定量PCR儀的溫度準(zhǔn)確度、孔間溫差、實時升溫速率、實時降溫速率、溫度過沖、溫度持續(xù)時間、上蓋溫度進(jìn)行校準(zhǔn)。熒光部分可以對定量PCR儀的Cq(Ct)相差值、精確度、熒光飽和值、熒光線性、熔解曲線精確度及一致性,熔解溫度的比例關(guān)系及線性靈敏度等進(jìn)行檢測。


公司背景介紹:

華譜&澤恒是專注于為生物制藥行業(yè)提供實驗室儀器計量校準(zhǔn)、GMP驗證服務(wù)/3Q驗證/設(shè)備確認(rèn)/廠房驗證的專業(yè)服務(wù)商。我們給制藥客戶解決的是一站式QC/QA/工程/驗證等事業(yè)部的質(zhì)控外包服務(wù)。

我們活躍于許多關(guān)鍵市場領(lǐng)域,從細(xì)胞/基因治療領(lǐng)域、抗體藥方向、干細(xì)胞治療到疫苗生產(chǎn)等生物制藥領(lǐng)域,一直以來都是圍繞生物醫(yī)藥客戶實現(xiàn)讓“讓制藥體系更安全"為使命,提高服務(wù)的效率、降低行業(yè)的成本、踐行好的客戶服務(wù)體驗。自主品牌:華譜(上海)檢測技術(shù)有限公司、澤恒計量檢測(北京)有限公司。


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